Причини збою менструального циклу можуть бути різними, залежно від віку жінки. У жінок старше 40 років причини порушення менструального циклуНайчастіше є органічними – міома матки, внутрішній ендометріоз, поліп ендометрію, ендометрит, захворювання крові та інше.
Однією з найчастіших причин нерегулярного циклу стають гормональні розлади. Дефіцит або надлишок вироблення гормонів щитовидної залози може збивати цикл. Подібним чином впливає надлишок гормону пролактину. Хронічні запальні процеси органів малого тазу також можуть збивати цикл.
У молодих дівчат збій менструації часто пов'язано з нерівномірним дозріванням гіпоталамо-гіпофізарної та яєчникової системи. Рідше причиною можуть бути вроджені або набуті синдроми, хромосомні захворювання або аномалії репродуктивної системи.