У супровідній записці, доданій до другого плівкового альбому гурту «Наутілус Помпіліус» сказано: «Група названа на честь голожаберного молюска, який від природи гарний і привабливий». За наявними даними, назва групи — НАУТІЛУС — була запропонована звукооператором Андрієм Макаровим у 1982 році.
Назва Офіційно група називається «Nautilus Pompilius». Nautilus pompilius – Систематичне назва виду молюсків роду наутілусів.
Наутілус (Від лат. Nautilus – "кораблик") – рід головоногих молюсків. Наутілус помпіліус – вид головоногих молюсків із сімейства Наутіліди. Наутілус макрофалус – вид головоногих молюсків із сімейства Наутіліди.
Наутілус, На відміну від усіх сучасних головоногих молюсків, володіє чотирма зябрами, і відповідно його серце має чотири передсердя (розташованих двома парами).