Високі дози ефірної олії полину можуть спричинити порушення роботи центральної нервової системи, судоми, занепокоєння, імпульсивна поведінка і навіть смерть. Тривале використання може призвести до незворотного пошкодження мозку та нервової системи. Також може викликати сильне звикання.
І в народній, і в традиційній медицині полин гірку використовують як протимікробний, протигрибковий та антивірусний засіб. Вона також має жовчогінну, протипаразитарну, болезаспокійливу та протиракову дію.
Не можна полин гірку приймати вагітним жінкам, при виразковій хворобі шлунка та ерозивних гастритах.