Гайдн помер 31 травня 1809 року у Відні невдовзі. після нападу на Відень французької армії під проводом Наполеона. Серед його останніх слів була спроба заспокоїти своїх слуг, коли на околицях будинку впало гарматне ядро: «Не бійтеся, діти мої, бо там, де Гайдн, ніякої шкоди не може бути».
Бетховен іронізував над образотворчими моментами в ораторіях Гайдна, а той називав учня «Великим Моголом» — натякаючи і його дикі манери, і незвичне звучання бетховенских творів. Тим не менш, до кінця життя Гайдна композитори тісно спілкувалися.
Композитор Франц Йозеф Гайдн є автором 24 опер, написаних у 70-х – 80-х роках XVIII століття Гайдн очолював трупу придворного театру князя Миколи Естерхазі, який показував до 150 вистав на рік.
Bergkirche Йозеф Гайдн / Місце поховання