Насіння утворюється після двох процесів: запилення та запліднення. Запліднення протікає всередині самої шишки. Запилення – перенесення пилку з чоловічих шишок на жіночі відбувається за допомогою вітру. Тому для розмноження голонасінних рослин вода взагалі не потрібна.
Головна відмінність голонасінних рослин від спорових – розмноження насінням. Насіння цього рослин не захищені оплоднем, так як у них плід не утворюється.
Розкриття відбувається через 2-3 роки після запилення. У сосни їхнього поширення є крильця, які легко підхоплюються вітром і розносяться більш далекі відстані. На відміну від папоротей та мохів для запліднення голонасінний рослинам не потрібна вода.
По-перше, для обох основним способом розмноження є насіння. По-друге, в обох є пилок для запліднення. Але якщо у більшості покритонасінних пилок розноситься за допомогою комах, то у голонасінних це робиться для деяких видів за допомогою комах, а для інших завдяки вітру.