У 989 році через сильний землетрус обвалився купол собору, який був відновлений через п'ять років. У 1453 після захоплення Константинополя турками султан Мехмед II перетворив собор Святий Софії в мечеть. Після захоплення собору збережені в ньому численні цінності були розграбовані, а стародавні ікони знищені.
Собор Святої Софії у Константинополі протягом цілого тисячоліття залишався головною християнською церквою у Візантійській імперії. В 1453 султан Мехмед Завойовник напав на столицю Візантії і підпорядкував її собі, але великий собор руйнувати не став.
1 квітня православні віруючі святкують пам'ять святої Софії Слуцькій Свята Софія, чию пам'ять Православна церква вшановує 1 квітня, прославилася своїм твердим віросповіданням.