Як блакитні очі з'явились у собак, досі вивчено погано. У деяких порід, таких як вельш-корги або бордер-коллі, очі зрідка бувають блакитного кольори і це пов'язано з мутаціями в генах PMEL17 та MITF. Ці гени кодують білки, що регулюють розвиток меланоцитів – клітин, що містять меланін.
Насправді ж це блакитні, які закрив коричневий пігмент. Це генетична мутація.
Чому у собаки різні очі Гетерохромію викликає повну або часткову відсутність пігменту меланіну в одному з двох око. У собак з гетерохромією через нестачу меланіну один око стає блакитним або блакитно-білим. Гетерохромія у собак часто буває спадковою, тобто передається генетично.