Контртерористична операція (КТО) на території Чечні була оголошена незабаром після цього, у вересні 1999 року. Активна фаза бойових дій тривала до кінця лютого 2000 року і завершилася зі взяттям федеральними силами під контроль Шатойського району Чечні.
Розпочалася 7 серпня 1999 року (дата Вторгнення бойовиків у Дагестан). Активна фаза бойових дій тривала з 1999 до 2009 року, потім, у міру встановлення контролю Збройними силами Росії над територією Чечні, перейшла у відання місцевих чеченських сил самоврядування і самооборони.
Таким чином, штурм був затриманий на 10 днів. Унаслідок контратаки бойовиків на вулиці Коперника загинув генерал-майор Михайло Малофєєв – заступник командувача угруповання “Північ”. Загальна кількість втрат федеральних сил за весь час облоги Грозного за офіційними даними сягнула 500 осіб, з яких 120 убитих.