Тривалість терапії становить від 4 до 10 днів залежно від термінів настання ремісії. У разі стоматитів, гінгівітів, пародонтитів рекомендується полоскання ротової порожнини 10-15 мл препарату 3-4 рази на добу.
Тонзиліти, фарингіти і ларингіти лікують полосканням горла та/або зрошенням за допомогою насадки-розпилювача, 3-4-кратним натисканням 3-4 рази на добу.
Не рекомендується Мірамістин® у вигляді спрею для немовлят для горла, а також у дітей віком до 3 років з метою зрошення мигдаликів і глотки, зважаючи на ризик реактивного ларингоспазму.