При кишковому амебіазі метронідазол застосовують у добовій дозі 1500 мг (розділеній на 3 прийоми) протягом 7 днів. У разі гострої амебної дизентерії добова доза становить 2250 мг (розділена на 3 прийоми). Дітям від 6 до 15 років призначають добову дозу 500 мг (розділену на 2 прийоми).
Препарат активний щодо Trichomonas vaginalis, Gardnerella vaginalis, Giardia intestinalis, Entamoeba histolytica, облігатних анаеробних бактерій: Bacteroides spp.
Метронідазол показаний для лікування гострого кишкового амебіазу (амебної дизентерії) та абсцесу печінки, спричиненого амебами. При лікуванні метронідазолом абсцесу печінки, спричиненого амебами, не виключена необхідність аспірації або дренування гною. Анаеробні бактеріальні інфекції.