Молоко недостатньо сепарується (знежирюється), якщо воно холодне або погано очищене від домішок, а також якщо неправильно зібрано барабан, слабо затягнута його гайка або він низько посаджений, не відрегульовано зливний гвинт або засмічено його отвір.
Знос гумової прокладки між гонкою та чашками. Занадто гаряче молоко. Вершник не до кінця накручений.
Підвищення температури молока сприяє зниженню його в'язкості та переходу жиру в рідкий стан, що покращує сепарування. Оптимальна температура сепарування 35…45 °С.
Сепарування застосовують для поділу молока на вершки та знежирене молоко, а також для його очищення від механічних та природних (кров, слиз тощо) домішок. Крім цього при сепаруванні із сироватки виділяють білки, отримують високожирні вершки, відокремлюють мікроорганізми від молока (бактеріовиділення) та ін.