Сучасний інтер'єр станції було створено під час реконструкції 1973-1975 років. Свою нинішню назву станція отримала Луб'янською площею, під якою розташована.
Назва Луб'янка вперше згадано в літописі в 1480 році, воно дано на честь району Новгорода – Луб'яниць, після того як Іван III наказав новгородцям, виселеним до Москви після падіння республіки, селитися в районі нинішньої Луб'янської площі.
Наприкінці 1930-х Лосиноостровськ був перейменований на Бабушкін на честь полярного льотчика Михайла Бабушкіна, що народився і виріс у цих місцях. Місто Бабушкін увійшов до складу Москви в 1960 році. Будівництво станції метро «Бабушкінська», 1976-78 рр.
Назва станції було затверджено постановою Уряду Москви на підставі пропозиції міської міжвідомчої комісії щодо найменування територіальних одиниць, вулиць та станцій метрополітену. Бутирський район, ім'я якого має станція метро – один із найстаріших у столиці.